Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms