Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod3E9QA62 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod3E9QA62 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms