Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pate1E9Q658 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pate1E9Q658 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pate1E9Q658 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pate1E9Q658 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pate1E9Q658 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pate1E9Q658 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pate1E9Q658 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pate1E9Q658 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms