Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm9972E9Q053 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms