Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx60E9PZQ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms