Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms