Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms