Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms