Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfbr3lD3YZZ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms