Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms