Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms