Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cspp1B2RX88 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspp1B2RX88 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms