Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms