Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms