Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Usf3B2RUQ2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms