Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms