Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp42B2RQC2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms