Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ssxb8B1AY40 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ssxb8B1AY40 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssxb8B1AY40 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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