Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn3aA2ASI5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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