Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttll9A2APC3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms