Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syndig1A2ANU3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms