Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GabreA2AMW3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms