Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cavin4A2AMM0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin4A2AMM0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms