Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp8nlA2ABX0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms