Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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