Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms