Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Nme3Q9WV85 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme3Q9WV85 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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