Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms