Protein–RNA interactions for Protein: Q9R053

Scn11a, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn11aQ9R053 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn11aQ9R053 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn11aQ9R053 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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