Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn8Q9QZ49 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms