Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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