Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rad18Q9QXK2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms