Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms