Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dkk3Q9QUN9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dkk3Q9QUN9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms