Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms