Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rabgef1Q9JM13 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rabgef1Q9JM13 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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