Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ap3m1Q9JKC8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms