Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ybx3Q9JKB3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms