Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tuba8Q9JJZ2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tuba8Q9JJZ2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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