Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmbr1Q9JIT0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms