Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smco4Q9JIS3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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