Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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