Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clstn2Q9ER65 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms