Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms