Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clstn1Q9EPL2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms