Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms