Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Med27Q9DB40 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Med27Q9DB40 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Med27Q9DB40 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Med27Q9DB40 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Med27Q9DB40 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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