Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Smim23Q9DAL0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms