Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Echdc3Q9D7J9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms