Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tube1Q9D6T1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms